要想顺利通过火影忍者风主90精英副本，首先需要搭建一个以风主为核心的高效阵容。风主的天赋建议选择连击和风强，以最大化输出效率。在忍者选择上，可以搭配能形成高连击追打链的忍者，例如鸣人、李和手鞠等少年篇角色，他们的技能能协同触发多次追击。秘卷技能根据副本类型适配，在防御型战斗中使用土遁・土流壁来抵挡正面伤害，而在需要快速清场时选择卷轴・疾风提升攻速和移速。通过合理配置阵容和天赋，能显著提高副本通关的稳定性。
提升角色战斗力是过关的关键，可以通过多刷冒险副本和精英副本来获得天赋点和装备材料。三星通关新的冒险关卡能获得天赋点，用于增加生命、攻击和防御加成。参与活动副本如小队突袭、生存挑战和修行之路，能获取秘卷碎片、声望、忍玉、勾玉等资源，这些都能在不同方面提升战斗力。每日挑战丰饶之间可以获得大量经验、铜币和声望，支持角色等级提升和通灵术修炼。装备升级和进阶，以及通灵兽的培养，也能直接增强角色的综合属性。
开局不要第一时间突进，可以使用通灵兽如蛤蟆来换取对方忍者的替身，并躲避高伤害技能如风压阵或山椒鱼。起手时利用风压阵或水冲波等技能进行攻击，在技能冷却期跑酷并抓住时机反打。由于精英副本中受击保护时间较长，可以使用熟悉忍者进行连续攻击，但要注意对方的奥义点和替身冷却，避免贪刀导致反击。时间把握很重要，避免使用跑酷流忍者，因为时间结束会自动判定失败，所以要确保在限时内完成输出。
资源分配上，优先将风主和输出忍者的奥义技能满级，追击技能点到适当等级即可满足连击需求。装备方面，风主穿暴击套如疾风传套装，输出忍者堆攻击属性，辅助角色堆生命值，避免属性浪费。在副本中，找到BOSS技能的破绽进行连招，倒地后不要近身，以免被起身技能击中。奥义释放时处于无敌状态，可以用来保命或造成大量伤害。如果输出不足，可以考虑调整阵容，替换为高爆发忍者来突破高防御敌人，同时确保通过日常活动积累金币和材料，以持续强化战力。
